Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lactb2Q99KR3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms