Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms