Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp11Q99K46 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms