Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms