Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms