Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms