Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf112Q96DY5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf112Q96DY5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms