Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sirt1Q923E4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms