Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms