Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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