Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg13Q91YI1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg13Q91YI1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms