Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE6

Ipo9, Importin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo9Q91YE6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ipo9Q91YE6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ipo9Q91YE6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms