Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snx11Q91WL6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snx11Q91WL6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx11Q91WL6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms