Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms