Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms