Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms