Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc71Q8VEG0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc71Q8VEG0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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