Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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