Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms