Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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