Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GcaQ8VC88 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GcaQ8VC88 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GcaQ8VC88 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GcaQ8VC88 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GcaQ8VC88 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GcaQ8VC88 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GcaQ8VC88 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GcaQ8VC88 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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GcaQ8VC88 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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GcaQ8VC88 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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GcaQ8VC88 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcaQ8VC88 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms