Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BbxQ8VBW5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms