Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W5

Tsen15, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen15, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen15Q8R3W5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tsen15Q8R3W5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsen15Q8R3W5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms