Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc58Q8R3Q6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc58Q8R3Q6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc58Q8R3Q6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc58Q8R3Q6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc58Q8R3Q6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc58Q8R3Q6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc58Q8R3Q6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ccdc58Q8R3Q6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc58Q8R3Q6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc58Q8R3Q6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc58Q8R3Q6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc58Q8R3Q6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58Q8R3Q6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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