Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms