Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf183Q8QZS5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf183Q8QZS5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf183Q8QZS5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf183Q8QZS5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf183Q8QZS5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf183Q8QZS5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Rnf183Q8QZS5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rnf183Q8QZS5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf183Q8QZS5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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