Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Hoxc12Q8K5B8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxc12Q8K5B8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxc12Q8K5B8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxc12Q8K5B8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc12Q8K5B8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hoxc12Q8K5B8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hoxc12Q8K5B8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hoxc12Q8K5B8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc12Q8K5B8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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