Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec12Q8K4Q8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms