Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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