Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MyripQ8K3I4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms