Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sde2Q8K1J5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sde2Q8K1J5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms