Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh3Q8K1E6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms