Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc47a1Q8K0H1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms