Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FgbQ8K0E8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FgbQ8K0E8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms