Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms