Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh2d5Q8JZW5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms