Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps50Q8CI71 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms