Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnl3Q8CGK6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms