Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rab43Q8CG50 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab43Q8CG50 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab43Q8CG50 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab43Q8CG50 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab43Q8CG50 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab43Q8CG50 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rab43Q8CG50 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rab43Q8CG50 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rab43Q8CG50 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rab43Q8CG50 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab43Q8CG50 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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