Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFG9

C1rb, Complement C1r-B subcomponent, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1rbQ8CFG9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1rbQ8CFG9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1rbQ8CFG9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms