Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms