Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin52Q8CD94 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms