Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc27Q8CD92 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc27Q8CD92 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms