Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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