Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fbxo48Q8CAT8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo48Q8CAT8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms