Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms