Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms