Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms