Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms