Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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